Su deposu izolasyonu uygulamasında bütün izolasyon malzemeleri su deposunda kullanılamaz. Kullanılacak malzemenin antitoksit olması yani suya karşı zararlı bir etkisinin olmaması gereklidir. depo yüzeyinde beton,sıva veya seramik var ise bunlara karşılık olarak malzeme tercih edilmelidir.